Cyklistická doprava je jedním z ekologických druhů dopravy, které nezatěžují ulice města exhalacemi, hlukem a navíc nepotřebují tolik prostoru. K podpoře cyklistické dopravy hlavním městem Prahou se již dlouhá léta připojuje také organizace ROPID a s ní i celá Pražská integrovaná doprava. Snahou je usnadnit pomocí Pražské integrované dopravy pohyb cyklistů po Praze a dostat se i do hůře přístupných oblastí. V rámci systému PID je možné přepravovat jízdní kola v metru, v tramvajích, ve vlacích, na přívozech, ve speciálním cyklobusu a také cyklovlakem. 

Základní možností pro cestování s kolem veřejnou dopravou je síť pražského metra, která umožňuje přepravu kol prakticky v kteroukoli denní dobu. Ve vlastním zájmu cyklistů však je nevyužívat metro v nejzatíženějších obdobích přepravních špiček. Samozřejmostí by také měla být ohleduplnost k ostatním cestujícím vzhledem k vysoké koncentraci lidí ve stanicích, přestupních chodbách i ve vozech metra. Přeprava kol je v metru bezplatná.

Další, stále oblíbenější možností, je použití železnice. Nejjednodušší je přeprava kol jako spoluzavazadlo v elektrických jednotkách na hlavních příměstských tratích, zařazených do Pražské integrované dopravy a očíslované v rámci systému Esko. Kolům přátelské vlaky jsou v jízdním řádu označeny symbolem jízdního kola. V těchto vlacích se o jízdní kolo stará cestující sám a většina těchto vlaků má pro kola vyhrazený speciální prostor, opět označený symbolem kola. Cena za přepravu kola jako spoluzavazadlo je podle tarifu Českých drah 25 Kč za jednu jízdu bez přestupu nebo 50 Kč za celodenní přestupní jízdenku. Poněkud složitější je takzvaná úschova během přepravy, kdy se o jízdní kolo stará vlaková četa ve speciálním voze. Takové vlaky jsou v jízdním řádu označeny symbolem zavazadla a jedná se zejména o rychlíky. Taková forma přepravy kol je i mírně dražší (30 Kč jednorázové jízdné a 60 Kč celodenní jízdenka). „V rámci systému PID využívají cyklisté nejčastěji vlaky na lince S7 do údolí Berounky, S9 do Ladova kraje a do Posázaví, S2 do Polabí a také na lince S8 do Posázaví,“ popisuje oblíbené cíle cyklistů Václav Haas, specialista ROPIDu na železnici. Spolu s postupnou obnovou vlaků se zjednodušuje přeprava jízdních kol i na regionálních tratích, a to díky novým motorovým jednotkám Regionova s bezbariérovým přístupem.

V rámci Pražské integrované dopravy pomáhá Pražanům přiblížit zajímavá místa také cyklovlak a cyklobus. Cyklovlak Pražské integrované dopravy spojuje od dubna do začátku listopadu již druhou sezónu Prahu se severozápadní oblastí Středních Čech, kam pomáhá vyvézt nejen cyklisty, ale i pěší turisty. Lákadel okolo trati je mnoho - zřícenina hradu Okoř, lidický památník, důl Mayrau, budečská rotunda či historické město Slaný. „Při pěkném počasí přepraví cyklovlak VELO za víkend zhruba 120 cestujících a 60 jízdních kol. Za celou první loňskou sezónu přepravil cyklovlak téměř 7000 cestujících a něco přes tisícovku kol,“ upřesňuje Václav Haas. Cyklovlak jezdí každý nepracovní den po dvou párech spojů. Přeprava se řídí tarifem Českých drah, ale díky zařazení v systému PID lze s výhodou použít třeba pražské tramvajenky a ušetřit za pražský úsek.

Cyklobus jezdí každý nepracovní den od dubna do začátku října čtyřikrát denně od dobřichovického nádraží přes Mníšek pod Brdy do Kytína a zpět. V Dobřichovicích navazuje speciálně upravený autobus na vlaky linky S7 od Prahy a pomáhá vyvézt cyklisty k brdským hřebenům. Cena za přepravu kola cyklobusem je 26 Kč, při ukázání platné jízdenky z vlaku pouze 13 Kč. „Cyklobus si za necelých 6 let získal poměrně stálý počet cestujících, kterých se za víkend pohybuje v průměru kolem 60. Jen za loňskou sezónu přepravil brdský cyklobus skoro 2000 kol,“ říká Tomáš Prousek z odboru plánování ROPID.

Velkou pomocí pro cyklisty v nesnadném pražském terénu se staly přívozy, které díky zařazení do systému PID umožňují přepravu kol zdarma. „Nejvíce si cyklisté oblíbili přívozy P1 a P2 na severu Prahy, které umožňují rychlé spojení obou vltavských břehů bez nutnosti dlouhých objížděk. První tři přívozy přepraví dohromady denně přes stovku kol. Zájem cyklistů očekáváme i na novém přívozu P5, který výhodně spojuje Císařskou louku s oběma vltavskými břehy,“ doplňuje Tomáš Prousek.

V dubnu letošního roku byl spuštěn pilotní projekt povolení přepravy kol v pražských tramvajích. Jedná se pouze o vybrané, tzv. „výtahové“ úseky tramvajových tratí, vedených zejména do kopců na okrajích Prahy a pouze ve směru z centra. Na vybraných zastávkách, které jsou viditelně označeny symbolem jízdního kola, mohou po svolení řidiče nastoupit cestující s kolem na zadní plošinu tramvajových vozů nebo na plošinu určenou pro kočárky. Pro zachování možnosti přepravy invalidních vozíků je zakázána přeprava kol v garantovaných nízkopodlažních spojích, které jsou v jízdním řádu vyznačeny symbolem invalidního vozíku.

Pro ty, kteří potřebují přepravit kolo na ruzyňské letiště, je tu linka Airport Express, která spojuje letiště se stanicí metra Dejvická a holešovickým nádražím. V autobusech linky AE je přeprava kol bezplatná, ale jízdní kolo je nutné mít již zabalené pro leteckou přepravu.